神魔之战也给大荒之地带来了巨大的影响。人类了解到自己身体内原来蕴涵有惊人的潜力，於是一些人开始进行修行，试图象伏羲一样，飞升成仙。道术　仙法的修行激发出他们体内的天地元气之力，让他们拥有如同仙神般飞天遁地，负海担山的能力。另一方面，妖魔也打开了人心中邪恶的匣子，种种以前不曾有过的劣根性都显露了出来。

　　权谋、诡计、奸诈、自私、邪恶的心性让许多修行之人走火入魔，堕入魔道成了妖魔，也让大荒之上充满了争斗和杀戮，原来的乐土不复存在。妖魔退去之後不足百年，人间界立刻爆发大乱。

　　其中，炎帝的神农部落和黄帝的有熊部落战况最为激烈且影响深远，不满天帝伏羲统治的火神祝融把自己的离火神兵借予炎帝，而因共工之败，早对祝融不满的雷神雨师则采首山之铜，为黄帝姬轩辕铸就了天下第一神兵──轩辕剑。

　　得到神兵的两人率领军队，在阪泉展开决战。炎黄二帝在九天之上，以神兵进行惊天动地的对决，最终王道之剑胜过了五金之精，离火神兵断为两截，散於人间，消失无踪。而炎帝军则大败，被黄帝赶到南方偏远的九黎之地，苟延残喘，黄帝姬轩辕成为了人间界中原大荒的统治者。

　　尽管战争中黄帝最终胜出，但战乱灾害对人类造成却远未有人预料，离火神兵与轩辕剑的对决，带来巨大能量冲击，不仅对人间界造成巨大损害，毁灭地上无数人的家园，而且在西蜀之地，巴山之上劈开一个巨大裂口。被称为“万魔渊”的裂口因天地元气异变而成为连接妖魔界的通路。

　　借由此处，妖魔不需要通过太古铜门就可以来往於人间妖魔两界，一时间，妖魔又大有蠢蠢欲动之势。黄帝之师广成子见万魔渊魔气冲天，不忍人间生灵涂炭，於是舍全身法力，将自己肉身和佩剑化为锁妖塔，沈入万魔渊中，封住了裂口。更命自己弟子後人在巴山上建起名为弈剑听雨阁的剑派，永远镇守万魔渊。

　　万魔渊虽被广成子以牺牲自己的方式所封印，但因充斥其间的天地元气太过杂乱，仙界已无法将其修补。修炼出关的天帝对此结果大为震怒，将祝融打下人间界，经七世轮回，才可重回仙界，并下令关闭人间界与仙界的通路，严禁众仙神与人随意进行接触，从此人神完全隔绝。然而，世间的动乱还并未走到终结之地……

　　历经世世代代，太古铜门依然伫立在大荒之界，岁月的摧残，即使是这道由众神守护的铜门也开始腐朽，从妖魔界透露出的腐气渐渐向大地漫延，百年前冰心堂的掌门紫荆为救治世人到太古铜门附近采药被腐气所伤一睡不醒，深爱她的弈剑听雨阁的掌门卓君武则遍寻大荒为她寻求解药。